众人开始研究这层防护力量的特点，发现它是由一种复杂的能量矩阵构成，不断地变换着形态和频率。小红凭借着对古老文明知识的了解和水晶球赋予的感知能力，开始尝试破解这层能量矩阵的密码。

她闭上眼睛，集中精神，手中的水晶球缓缓升起，散发出五彩斑斓的光芒。光芒与防护力量相互交织，形成了一幅幅神秘的图案。小红仔细观察着这些图案的变化，寻找着其中的规律和破绽。

经过长时间的努力，小红终于找到了破解能量矩阵的方法。“大家听好了，我会用水晶球的力量打开一个短暂的缺口，你们要在这个时间内将飞船驾驶进去。”

小辉深吸一口气，紧紧握住操控杆，准备迎接这关键的一刻。当小红运用水晶球打开缺口的瞬间，小辉毫不犹豫地驾驶着飞船冲了进去。

飞船成功进入了“原初之核”的内部区域，这里的能量更加狂暴和混乱。巨大的能量漩涡四处涌动，仿佛要将飞船吞噬。

“我们要找到‘原初之核’的核心能量点，将水晶球的力量注入其中，才能修复宇宙的秩序。”小红大声说道。

他们小心翼翼地在能量漩涡中穿梭，凭借着水晶球的指引，终于找到了核心能量点。这是一个散发着耀眼白光的球体，周围环绕着强大的能量流。

小辉操控着飞船靠近核心能量点，然后众人一起将水晶球的力量缓缓注入其中。随着水晶球力量的注入，核心能量点开始发生变化，原本狂暴的能量逐渐变得稳定下来，黑暗的气息也在慢慢消散。

然而，就在他们即将完成修复工作的时候，克洛诺斯的残魂突然出现。虽然他的身体已经被摧毁，但他的邪恶意志却依附在这片黑暗能量中，企图阻止他们修复宇宙秩序。

“你们以为这样就能轻易地打败我吗？宇宙的混乱将是我的重生之地！”克洛诺斯的残魂发出阴森的咆哮声，向着他们发动了疯狂的攻击。

黑暗能量化作各种恐怖的形态，如黑色的巨龙、尖锐的利刺，朝着飞船扑来。小辉等人迅速启动飞船的防御系统，同时准备进行反击。