史料记载，吾必奎造反之后接下来的事情就越来越乱了，其造反之后，沐天波和云南巡抚传檄各土司联合出兵镇压讨伐，可问题就出在联兵里的一个土司沙定洲！

沙定洲是蒙自土司，也是个野心家，他十分垂涎沐王府的财富，每次听到沐王府门客形容沐王府有多富的时候他都流一地哈喇子，他一直想侵占沐王府然后取而代之成为云南的王。

沐王府到底有多富有呢，金银财宝无数，只论土地据万历年间的记载已有八千顷占当时云南土地三分之一。

当沙定洲发兵至昆明时吾必奎已被平定，但沙定洲不肯撤兵，里应外合趁虚入了城，率部攻入沐王府大肆掠夺，沐天波此时才知引狼入室只是为时已晚，惊慌之下只得往城外跑，其母及妻来不及跑，便自焚了。

而后沙定洲便将昆明及沐王府轻而易举的占领了。然后就想取而代之镇守云南，胁迫或伪造云南巡抚吴兆元、在籍大学士禄丰人王锡衮给隆武朝廷上疏，说：“天波反，定洲讨平之，宜以代镇云南。”

但事情还没完，当时参与讨伐吾必魁的土司里有石屏土司龙在田，这人对沐家比较忠心一心想为沐家报仇奈何实力不允许，但他和张献忠的养子孙可望有交情，而这时张献忠已死，孙可望和李定国已率兵进入贵州了，龙在田便派人抄小道去联络孙可望让他率领大西军来给沐家报仇“借大义讨贼，全省可定也”。

于是孙可望就假称是沐天波小舅子请来的救兵来报仇的，率兵进攻昆明，沙定洲这种货色哪里打得过他这个沙场悍将，几下就被按在地上摩擦扒皮处死，然后正式接手了云南，当时云南巡抚吴兆云还亲自迎接大西军进城呢，毕竟那时候他们和沙定洲打仗的同时，清军也从北京一路往南打，那个时候不管是大顺军还是大西军大部分都是和南明朝廷合作一致对外的。

孙可望占领云南后就给逃往在外的沐天波写信，你放心回来吧，仍以勋贵之礼相待，只是谁都知道军政大权已不属于沐家了，最终沐天波也是回来了，但成了一个伤心人，不过很快他就不孤单了，因为另一个伤心人来了，南明永历帝。

因沐家世代功勋沐天波成了百官之首，其实也就是个光杆司令，后来的事情大家都知道了，清军来了他们逃如缅甸，沐被缅王杀害，永历帝被吴三桂以弓弦勒死！

这便是吾必魁造反引发的一连串后果。

从这场叛乱起到沙定洲被干掉历时三年，这三年期间沙定洲不停的四处攻打沐天波的藏身之地，还企图让朝廷认定他的新云南王身份，直至孙可望率兵过来见他一顿捶死。同样这三年期间清军从北京一路打到南京打到四川打到贵州打到云南然后将南明逼入缅甸。

若无这场叛乱，云南百姓不会死伤无计，沐王府犹在朝廷还保存一大实力，不至于让清军那么容易打进云南，甚至当时联合大顺军和大西军或者可阻敌南下偏安云南一角，至少即便被逼入了缅甸也还有强大实力不至于受后来的各种屈辱，亦不会被吴三桂给捉了去。